跳转到内容
← 返回化学家
结构化学1910–19949 分钟阅读

多萝西·霍奇金

Dorothy Crowfoot Hodgkin

你怎么"看见"一个分子里原子的真实排列?它太小,任何显微镜都无能为力。 霍奇金给出的答案是:不用眼睛看,用 X 射线"摸"。

X射线晶体学青霉素结构维生素B12胰岛素诺贝尔化学奖

你怎么"看见"一个分子里原子的真实排列?它太小,任何显微镜都无能为力。

霍奇金给出的答案是:不用眼睛看,用 X 射线"摸"。

她是 20 世纪最伟大的晶体学家之一,用 X 射线衍射,第一次解出了青霉素、维生素 B₁₂、胰岛素这些庞大复杂的生物分子的三维结构。1964 年,她因此独得诺贝尔化学奖,成为继居里夫人(marie-curie)、伊雷娜·约里奥-居里之后,史上第三位获化学奖的女性。

破除误解:X 射线晶体学不是"拍照"

很多人以为,解出分子结构就像给分子拍一张高清照片,按下快门就完事。

完全不是。

X 射线照射晶体后,并不会形成一张分子的"像",而是被晶体里规则排列的原子散射,在底片上留下一片由亮点组成的、抽象的衍射图样

这片亮点里,藏着原子位置的信息,但它是加密的。

科学家必须反过来,从这些点的位置和强度,用大量数学计算去反推原子在哪里——这就是著名的"相位问题",是整个晶体学最烧脑的核心难关。

在没有电子计算机的年代,霍奇金和同事是用手摇计算器、对着海量数据一点点算出来的。解一个复杂分子,往往要算上好几年。

三座高峰:青霉素、B₁₂、胰岛素

霍奇金一生攻下了三座当时被认为"不可能"的结构。

青霉素(1940 年代):二战期间,青霉素是救命的抗生素,但没人确知它的分子长什么样。霍奇金解出了它的结构,揭示了一个紧张的"β-内酰胺四元环"——正是这个高张力小环,让青霉素能精准破坏细菌的细胞壁。她解结构时,青霉素是当时被 X 射线分析过的最大分子。

维生素 B₁₂(1956 年):这是个更庞大、更复杂的分子,中心还坐着一个钴原子。当年被誉为 X 射线晶体学的"巅峰之作"——无论从化学、生物学的重要性,还是从结构本身的复杂程度看,都是空前的成就。

胰岛素:这是她最钟爱、也最艰难的目标。她从 1934 年读博时就开始研究胰岛素晶体,直到 1969 年才彻底解出——整整 35 年,比她获诺奖还晚了五年。这份执着,本身就是科学精神的注脚。

生平与现场:在病痛中坚持的一双手

霍奇金的科研之路并不顺遂。

她出生在埃及(父母是英国考古学家),少年时便被矿物晶体迷住。在那个女性极难进入科学界的年代,她考进牛津、又到剑桥深造。

二十多岁起,她就患上严重的类风湿关节炎,双手逐渐变形、疼痛伴随终生。

但她偏偏从事着最需要精细操作的工作——摆弄脆弱的晶体、对准仪器。她忍着剧痛,用一双变形的手,做出了最精密的结构测定。

她也是出色的导师。后来成为英国首相的撒切尔夫人,年轻时就在牛津做过霍奇金的学生。

数字:为什么胰岛素花了三十四年

霍奇金 1935 年拍下第一张胰岛素晶体的 X 射线衍射图,1969 年才解出结构。这三十四年不是拖延,而是三重困难叠加:

第一,相位问题。 衍射实验只能测到每个斑点的强度,而重建电子密度需要强度和相位两者。相位信息在测量中丢失了——这是晶体学的根本困难。解决办法是重原子置换:往蛋白质里塞进一个汞或铅原子作为参照点,从它引起的衍射变化反推相位。霍奇金在青霉素与 B₁₂ 上把这套方法磨了出来。

第二,规模。 青霉素分子约 40 个原子,B₁₂ 约 180 个,胰岛素约 800 个。需要处理的衍射斑点数量随分子大小急剧增长,而当年的计算全靠手摇计算机和早期电子计算机——B₁₂ 的解析动用了加州大学的计算机资源,是计算机首次在结构化学中扮演关键角色的案例之一。

第三,晶体质量。 蛋白质晶体含大量水,脆弱、易脱水、衍射能力弱。要长出足够好的胰岛素晶体本身就是多年的实验工作。

这段历史解释了一件事:为什么"结构生物学"直到二十世纪后半叶才成为可能。 它不是等某个理论突破,而是等相位方法、计算能力和晶体制备三条线同时成熟。

对比今天:AlphaFold 一类方法可以在几分钟内给出蛋白质结构的高精度预测。但值得注意的是——这些方法的训练数据,正是霍奇金那一代人用几十年一张张解出来的实验结构。没有那个数据库,预测无从学习。

争议与时代:被低估的女科学家

霍奇金的成就毋庸置疑,但她的故事也折射出那个时代对女科学家的偏见。

1964 年她获诺奖时,英国一家报纸的标题竟是《牛津家庭主妇赢得诺贝尔奖》——把一位顶尖科学家首先定义为"主妇"。

这种轻慢并非个例。和许多女科学家一样,她的工作长期被置于男性同行的光环之下,直到晚年才得到充分承认。

她本人则把精力投向了更广的事业:作为坚定的和平主义者,她长期推动东西方科学交流与裁军,担任过帕格沃什科学与世界事务会议主席——这一面,与同样跨越科学与公共良知的居里夫人遥相呼应。

跨域连接

  • 抗生素耐药:1945 年她确认青霉素含有当时颇受质疑的四元 β-内酰胺环,这个高张力环既解释了药物为何不稳定,也指明了可改造的位置。知道环在哪里,才能替换侧链造出耐酸、耐青霉素酶的半合成品种;而这些改造反过来筛选出谱系更广的 β-内酰胺酶。同一份结构知识,同时加速了攻与守。
  • 糖尿病治疗:1969 年解出的胰岛素结构显示它围绕锌离子聚成六聚体。皮下吸收的快慢取决于六聚体解离成单体的速率,而不取决于总剂量——这条机制来自结构而非药理观察。后来的速效与长效类似物,正是通过替换影响自聚的少数残基来改写起效曲线的。
  • 傅里叶反演与算力:从衍射斑点反推电子密度是一次傅里叶反演,而衍射只记录强度、丢掉了相位。算力决定能处理多少个反射,因而直接决定可解分子的大小,她的团队是最早用电子计算机做傅里叶合成的实验室之一。相位问题则说明另一半道理:光有快速算法不够,还需要重原子置换这类物理手段补回丢失的信息。
  • 生物有机金属化学:1956 年维生素 B₁₂ 的结构里出现了一个钴—碳键,而在此之前,生物体内被认为不存在金属与碳的直接成键。这一个键把有机金属从人工试剂领域推进了细胞内部,也解释了 B₁₂ 依赖酶为何能催化自由基重排:钴碳键均裂产生的自由基,正是反应的引发者。
  • 科学家的跨国渠道:她在 1976 至 1988 年主持帕格沃什科学与世界事务会议,任期为历任最长。这类组织起作用的机制不是发表主张,而是提供官方渠道之外的技术对话通道:双方专家先就核查手段、当量估算这类可验证的问题收敛分歧,谈判者再在已被收窄的技术空间里议价。

参考文献

  • Hodgkin, D. C. et al. "Structure of Vitamin B12." Nature, 178, 1956. DOI: 10.1038/178064a0
  • Crowfoot, D., Bunn, C. W., Rogers-Low, B. W. & Turner-Jones, A. "The X-ray crystallographic investigation of the structure of penicillin." In The Chemistry of Penicillin, Princeton University Press, 1949.
  • Ferry, G. Dorothy Hodgkin: A Life, Granta Books, 1998.
  • Perutz, M. F. "Dorothy Crowfoot Hodgkin (1910–1994)." Nature, 371, 1994. DOI: 10.1038/371020a0

延伸阅读

  • The Royal Swedish Academy of Sciences. "The Nobel Prize in Chemistry 1964 — Dorothy Crowfoot Hodgkin." Nobel Foundation, 1964.